Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EFR3AQ14156 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFR3AQ14156 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms