Protein–RNA interactions for Protein: Q14114

LRP8, Low-density lipoprotein receptor-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP8Q14114 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP8Q14114 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP8Q14114 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms