Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC2Q13868 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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