Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PMS2P11Q13670 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P11Q13670 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms