Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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DNASE1L3Q13609 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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DNASE1L3Q13609 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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DNASE1L3Q13609 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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DNASE1L3Q13609 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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DNASE1L3Q13609 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNASE1L3Q13609 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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