Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAE1Q13564 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAE1Q13564 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAE1Q13564 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAE1Q13564 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NAE1Q13564 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NAE1Q13564 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NAE1Q13564 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAE1Q13564 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAE1Q13564 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAE1Q13564 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NAE1Q13564 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NAE1Q13564 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NAE1Q13564 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAE1Q13564 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NAE1Q13564 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NAE1Q13564 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NAE1Q13564 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NAE1Q13564 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAE1Q13564 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NAE1Q13564 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAE1Q13564 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAE1Q13564 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NAE1Q13564 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NAE1Q13564 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NAE1Q13564 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAE1Q13564 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NAE1Q13564 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NAE1Q13564 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
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NAE1Q13564 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NAE1Q13564 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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