Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.614e-9■■■■■ 29
TARDBPQ13148 KDM4B-205ENST00000588337 504 ntTSL 527.06■■□□□ 1.922e-6■■■■■ 29
TARDBPQ13148 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 29
TARDBPQ13148 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 29
TARDBPQ13148 FGF13-206ENST00000448673 652 ntTSL 510.48□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 29
TARDBPQ13148 FGF13-205ENST00000441825 1625 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 29
TARDBPQ13148 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.093e-21■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.393e-21■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 CALU-201ENST00000249364 3357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.623e-21■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 CALU-206ENST00000542996 4225 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.823e-21■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.283e-21■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 MOB1B-205ENST00000511449 627 ntTSL 317.19■□□□□ 0.341e-8■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.341e-8■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 MOB1B-203ENST00000502869 760 ntTSL 316.43■□□□□ 0.221e-8■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -01e-8■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.251e-8■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 MOB1B-204ENST00000509041 2056 ntTSL 211.48□□□□□ -0.571e-8■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 LCOR-209ENST00000540664 2213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.981e-8■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.491e-8■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.751e-8■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.941e-8■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 LRP8-211ENST00000496580 507 ntTSL 211.72□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 CBFA2T3-203ENST00000562719 539 ntTSL 510.53□□□□□ -0.728e-8■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.442e-8■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.713e-7■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.583e-7■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 RNF38-206ENST00000377885 4985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.873e-7■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.83e-7■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.813e-7■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.853e-7■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 WDR60-203ENST00000444851 2769 ntTSL 1 (best)12.9□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.433e-7■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 WDR60-205ENST00000467220 5410 ntTSL 212.31□□□□□ -0.443e-7■■■■■ 28.9
TARDBPQ13148 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.131e-8■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 PEX14-203ENST00000491661 637 ntTSL 29.69□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 FAF1-204ENST00000487898 681 ntTSL 34.32□□□□□ -1.722e-7■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.038e-7■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.588e-7■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 UBAP2L-207ENST00000428931 3988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 UBAP2L-201ENST00000271877 3997 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 UBAP2L-220ENST00000613315 3451 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 UBAP2L-202ENST00000343815 3411 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.72e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.442e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.322e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-228ENST00000639388 2514 ntTSL 516.5■□□□□ 0.232e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.152e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-236ENST00000640358 2313 ntTSL 515.6■□□□□ 0.092e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-244ENST00000640792 2452 ntTSL 514.77□□□□□ -0.052e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-216ENST00000638468 1788 ntTSL 514.77□□□□□ -0.052e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-247ENST00000640871 1045 ntTSL 514.39□□□□□ -0.112e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.112e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-225ENST00000639199 2137 ntTSL 514.04□□□□□ -0.162e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-227ENST00000639365 1584 ntTSL 513.73□□□□□ -0.212e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-212ENST00000638189 1945 ntTSL 512.87□□□□□ -0.352e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.352e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-214ENST00000638219 1425 ntTSL 512.56□□□□□ -0.42e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-223ENST00000639066 1180 ntTSL 512.06□□□□□ -0.482e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-242ENST00000640711 1083 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.592e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-219ENST00000638697 1705 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.612e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-246ENST00000640866 1973 ntTSL 511.12□□□□□ -0.632e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-237ENST00000640443 3929 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.642e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-239ENST00000640608 3871 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.672e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-207ENST00000572403 648 ntTSL 510.32□□□□□ -0.762e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-218ENST00000638634 3446 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.772e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 AC005670.2-202ENST00000639822 1564 ntTSL 510.06□□□□□ -0.82e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-213ENST00000638216 3574 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.832e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-230ENST00000639985 1618 ntTSL 59.8□□□□□ -0.842e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-217ENST00000638579 1273 ntTSL 59.35□□□□□ -0.912e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-243ENST00000640723 941 ntTSL 59.27□□□□□ -0.932e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-215ENST00000638374 2683 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.952e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-234ENST00000640138 3408 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.032e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-220ENST00000638838 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.042e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-229ENST00000639713 622 ntTSL 58.02□□□□□ -1.132e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-238ENST00000640495 3395 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.132e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-232ENST00000640051 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.142e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.342e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.572e-25■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 PDXK-212ENST00000470029 583 ntTSL 319.3■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.249e-7■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.19e-7■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.079e-7■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 SLC39A3-205ENST00000589363 524 ntTSL 319.51■□□□□ 0.719e-7■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 SLC39A3-204ENST00000589166 491 ntTSL 29.97□□□□□ -0.819e-7■■■■■ 28.8
TARDBPQ13148 BMP2K-202ENST00000389010 2741 ntTSL 1 (best)19.15■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 28.7
TARDBPQ13148 TEAD1-202ENST00000525312 1134 ntTSL 1 (best)12.96□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 28.7
TARDBPQ13148 TEAD1-207ENST00000638666 1281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 28.7
TARDBPQ13148 ZFPM2-210ENST00000524235 574 ntTSL 46.59□□□□□ -1.351e-7■■■■■ 28.7
TARDBPQ13148 ZFPM2-205ENST00000520027 594 ntTSL 45.91□□□□□ -1.461e-7■■■■■ 28.7
TARDBPQ13148 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.488e-7■■■■■ 28.7
TARDBPQ13148 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.128e-7■■■■■ 28.7
TARDBPQ13148 DLG5-201ENST00000372391 7415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 28.7
TARDBPQ13148 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.073e-6■■■■■ 28.7
TARDBPQ13148 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 28.7
TARDBPQ13148 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 28.7
Retrieved 100 of 14,326 protein–RNA pairs in 224.8 ms