Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA1Q13131 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA1Q13131 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA1Q13131 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA1Q13131 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA1Q13131 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA1Q13131 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA1Q13131 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms