Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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