Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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