Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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