Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 KRE28YDR532C 1158 nt4.42□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 CAX4YGR036C 720 nt4.42□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YIL025CYIL025C 375 nt4.42□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 AIR1YIL079C 1083 nt4.42□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 PAN1YIR006C 4443 nt4.42□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 RFA3YJL173C 369 nt4.42□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 ELO3YLR372W 1038 nt4.42□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 THS1YIL078W 2205 nt4.42□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YIL001WYIL001W 1542 nt4.41□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YMR221CYMR221C 1515 nt4.41□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 RTK1YDL025C 1863 nt4.41□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 MSA1YOR066W 1890 nt4.41□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 HPC2YBR215W 1878 nt4.41□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 SAP155YFR040W 3009 nt4.41□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 GCR1YPL075W 2358 nt4.41□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YER158CYER158C 1722 nt4.41□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 PRM7YDL039C 2097 nt4.41□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 TRE2YOR256C 2430 nt4.41□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 EGT2YNL327W 3126 nt4.41□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YEA4YEL004W 1029 nt4.41□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YEL045CYEL045C 426 nt4.41□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 RNA15YGL044C 891 nt4.41□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YGR111WYGR111W 1203 nt4.41□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 GTT1YIR038C 705 nt4.41□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 PRX1YBL064C 786 nt4.41□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.41□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 EAR1YMR171C 1653 nt4.41□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 IMD2YHR216W 1572 nt4.4□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 ART10YLR392C 1557 nt4.4□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 KRS1YDR037W 1776 nt4.4□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 SEC9YGR009C 1956 nt4.4□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YOL075CYOL075C 3885 nt4.4□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 OCA4YCR095C 1089 nt4.4□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 TMA17YDL110C 453 nt4.4□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 AIM7YDR063W 450 nt4.4□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 TFB3YDR460W 966 nt4.4□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 RPL34AYER056C-A 366 nt4.4□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 YGL193CYGL193C 312 nt4.4□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 RTA1YGR213C 954 nt4.4□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 PSF2YJL072C 642 nt4.4□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt4.4□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 MNN11YJL183W 1269 nt4.4□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 IRC25YLR021W 540 nt4.4□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 FBP1YLR377C 1047 nt4.4□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 RPB8YOR224C 441 nt4.4□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 PSE1YMR308C 3270 nt4.4□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 HSP82YPL240C 2130 nt4.4□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 RPN4YDL020C 1596 nt4.4□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 YTM1YOR272W 1383 nt4.4□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 ESF1YDR365C 1887 nt4.39□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 YCL068CYCL068C 783 nt4.39□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 YCR101CYCR101C 549 nt4.39□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 SHU2YDR078C 672 nt4.39□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 SUR2YDR297W 1050 nt4.39□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 UBC8YEL012W 657 nt4.39□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 SPT15YER148W 723 nt4.39□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 DCV1YFR012W 609 nt4.39□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 BET1YIL004C 429 nt4.39□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 YOR338WYOR338W 1092 nt4.39□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 SRL4YPL033C 846 nt4.39□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 ICS2YBR157C 768 nt4.39□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 LEU1YGL009C 2340 nt4.39□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 YFL040WYFL040W 1623 nt4.39□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 ATH1YPR026W 3636 nt4.39□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 PCA1YBR295W 3651 nt4.39□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 MBP1YDL056W 2502 nt4.38□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 APM3YBR288C 1452 nt4.38□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 LYS2YBR115C 4179 nt4.38□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 GPR1YDL035C 2886 nt4.38□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 NUS1YDL193W 1128 nt4.38□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 RAD55YDR076W 1221 nt4.38□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 DPB4YDR121W 591 nt4.38□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 RIP1YEL024W 648 nt4.38□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 YER067C-AYER067C-A 324 nt4.38□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 ISC10YER180C 804 nt4.38□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 VMA22YHR060W 546 nt4.38□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 CNB1YKL190W 528 nt4.38□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 YKR070WYKR070W 1059 nt4.38□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 SMD2YLR275W 333 nt4.38□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 END3YNL084C 1050 nt4.38□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt4.38□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 POC4YPL144W 447 nt4.38□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 snR44snR44 211 nt4.38□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 JHD2YJR119C 2187 nt4.38□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 KTR6YPL053C 1341 nt4.38□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 LAP3YNL239W 1365 nt4.38□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 GWT1YJL091C 1473 nt4.37□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 TDA3YHR009C 1572 nt4.37□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 ALG11YNL048W 1647 nt4.37□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 DAS2YDR020C 699 nt4.37□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 BUD25YER014C-A 462 nt4.37□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 VMA7YGR020C 357 nt4.37□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 RFU1YLR073C 603 nt4.37□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 YOL106WYOL106W 354 nt4.37□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 HIS4YCL030C 2400 nt4.37□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 TRM11YOL124C 1302 nt4.37□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 MEK1YOR351C 1494 nt4.37□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 FLO8YER109C 2400 nt4.36□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 DET1YDR051C 1005 nt4.36□□□□□ -1.71
LCB4Q12246 RPL24BYGR148C 468 nt4.36□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.7 ms