Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms