Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4CQ08493 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms