Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP3CAQ08209 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP3CAQ08209 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms