Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN3Q08043 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN3Q08043 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms