Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FMODQ06828 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FMODQ06828 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FMODQ06828 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FMODQ06828 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FMODQ06828 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FMODQ06828 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FMODQ06828 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FMODQ06828 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FMODQ06828 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FMODQ06828 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FMODQ06828 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FMODQ06828 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FMODQ06828 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FMODQ06828 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FMODQ06828 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FMODQ06828 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FMODQ06828 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FMODQ06828 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FMODQ06828 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FMODQ06828 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FMODQ06828 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FMODQ06828 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FMODQ06828 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FMODQ06828 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FMODQ06828 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FMODQ06828 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FMODQ06828 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FMODQ06828 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FMODQ06828 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FMODQ06828 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FMODQ06828 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FMODQ06828 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FMODQ06828 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FMODQ06828 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FMODQ06828 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FMODQ06828 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FMODQ06828 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FMODQ06828 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FMODQ06828 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FMODQ06828 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FMODQ06828 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FMODQ06828 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FMODQ06828 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FMODQ06828 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FMODQ06828 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FMODQ06828 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FMODQ06828 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FMODQ06828 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FMODQ06828 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FMODQ06828 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FMODQ06828 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FMODQ06828 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FMODQ06828 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FMODQ06828 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FMODQ06828 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FMODQ06828 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FMODQ06828 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FMODQ06828 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FMODQ06828 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FMODQ06828 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FMODQ06828 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FMODQ06828 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FMODQ06828 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FMODQ06828 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FMODQ06828 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FMODQ06828 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FMODQ06828 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FMODQ06828 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FMODQ06828 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FMODQ06828 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FMODQ06828 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FMODQ06828 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FMODQ06828 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FMODQ06828 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FMODQ06828 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FMODQ06828 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FMODQ06828 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FMODQ06828 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FMODQ06828 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FMODQ06828 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FMODQ06828 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FMODQ06828 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FMODQ06828 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
FMODQ06828 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FMODQ06828 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FMODQ06828 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FMODQ06828 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FMODQ06828 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FMODQ06828 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FMODQ06828 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FMODQ06828 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FMODQ06828 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FMODQ06828 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FMODQ06828 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FMODQ06828 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FMODQ06828 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FMODQ06828 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FMODQ06828 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
FMODQ06828 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms