Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KDSRQ06136 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms