Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms