Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A2Q05940 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A2Q05940 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms