Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms