Protein–RNA interactions for Protein: Q03692

COL10A1, Collagen alpha-1(X) chain, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL10A1Q03692 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
COL10A1Q03692 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COL10A1Q03692 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms