Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ERCC6Q03468 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.16■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ERCC6Q03468 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms