Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms