Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms