Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD83Q01151 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD83Q01151 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD83Q01151 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD83Q01151 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD83Q01151 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD83Q01151 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD83Q01151 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CD83Q01151 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CD83Q01151 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD83Q01151 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD83Q01151 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD83Q01151 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD83Q01151 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD83Q01151 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD83Q01151 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD83Q01151 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD83Q01151 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD83Q01151 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD83Q01151 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD83Q01151 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD83Q01151 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD83Q01151 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD83Q01151 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD83Q01151 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD83Q01151 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD83Q01151 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD83Q01151 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD83Q01151 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CD83Q01151 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD83Q01151 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD83Q01151 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD83Q01151 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD83Q01151 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD83Q01151 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD83Q01151 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD83Q01151 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD83Q01151 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD83Q01151 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CD83Q01151 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD83Q01151 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD83Q01151 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD83Q01151 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD83Q01151 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD83Q01151 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD83Q01151 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CD83Q01151 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD83Q01151 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD83Q01151 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD83Q01151 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD83Q01151 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD83Q01151 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD83Q01151 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD83Q01151 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD83Q01151 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD83Q01151 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD83Q01151 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD83Q01151 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD83Q01151 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD83Q01151 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD83Q01151 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD83Q01151 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD83Q01151 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD83Q01151 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD83Q01151 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD83Q01151 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD83Q01151 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD83Q01151 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD83Q01151 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD83Q01151 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD83Q01151 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CD83Q01151 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD83Q01151 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD83Q01151 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD83Q01151 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD83Q01151 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD83Q01151 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD83Q01151 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD83Q01151 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD83Q01151 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD83Q01151 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD83Q01151 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD83Q01151 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD83Q01151 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD83Q01151 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD83Q01151 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD83Q01151 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD83Q01151 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD83Q01151 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD83Q01151 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD83Q01151 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD83Q01151 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD83Q01151 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD83Q01151 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD83Q01151 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD83Q01151 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD83Q01151 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD83Q01151 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD83Q01151 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD83Q01151 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms