Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FANCCQ00597 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms