Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
CDKL1Q00532 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms