Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX6P78412 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX6P78412 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX6P78412 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX6P78412 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX6P78412 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX6P78412 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX6P78412 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX6P78412 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX6P78412 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX6P78412 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX6P78412 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX6P78412 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX6P78412 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX6P78412 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX6P78412 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX6P78412 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX6P78412 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX6P78412 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX6P78412 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX6P78412 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX6P78412 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX6P78412 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX6P78412 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX6P78412 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX6P78412 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX6P78412 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX6P78412 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX6P78412 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX6P78412 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX6P78412 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRX6P78412 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRX6P78412 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRX6P78412 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRX6P78412 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRX6P78412 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRX6P78412 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRX6P78412 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRX6P78412 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRX6P78412 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRX6P78412 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
IRX6P78412 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
IRX6P78412 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRX6P78412 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX6P78412 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX6P78412 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX6P78412 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX6P78412 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX6P78412 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX6P78412 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IRX6P78412 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IRX6P78412 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IRX6P78412 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRX6P78412 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
IRX6P78412 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRX6P78412 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRX6P78412 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRX6P78412 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRX6P78412 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRX6P78412 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRX6P78412 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX6P78412 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX6P78412 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX6P78412 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX6P78412 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX6P78412 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX6P78412 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX6P78412 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX6P78412 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRX6P78412 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
IRX6P78412 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRX6P78412 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRX6P78412 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRX6P78412 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRX6P78412 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRX6P78412 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRX6P78412 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX6P78412 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX6P78412 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX6P78412 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX6P78412 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX6P78412 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX6P78412 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX6P78412 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX6P78412 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX6P78412 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX6P78412 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX6P78412 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX6P78412 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX6P78412 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX6P78412 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX6P78412 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX6P78412 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX6P78412 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX6P78412 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX6P78412 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX6P78412 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX6P78412 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX6P78412 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRX6P78412 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms