Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBX1P62877 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBX1P62877 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RBX1P62877 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBX1P62877 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBX1P62877 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBX1P62877 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBX1P62877 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBX1P62877 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RBX1P62877 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBX1P62877 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RBX1P62877 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBX1P62877 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBX1P62877 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBX1P62877 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBX1P62877 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBX1P62877 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBX1P62877 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBX1P62877 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBX1P62877 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBX1P62877 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBX1P62877 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBX1P62877 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBX1P62877 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBX1P62877 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBX1P62877 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBX1P62877 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBX1P62877 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBX1P62877 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBX1P62877 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBX1P62877 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBX1P62877 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBX1P62877 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBX1P62877 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBX1P62877 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBX1P62877 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBX1P62877 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBX1P62877 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBX1P62877 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBX1P62877 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBX1P62877 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RBX1P62877 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RBX1P62877 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBX1P62877 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBX1P62877 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBX1P62877 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBX1P62877 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBX1P62877 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBX1P62877 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBX1P62877 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBX1P62877 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBX1P62877 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBX1P62877 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBX1P62877 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBX1P62877 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBX1P62877 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBX1P62877 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBX1P62877 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBX1P62877 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBX1P62877 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBX1P62877 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBX1P62877 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBX1P62877 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBX1P62877 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms