Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HERVK_113P62684 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms