Protein–RNA interactions for Protein: P62424

RPL7A, 60S ribosomal protein L7a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL7AP62424 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL7AP62424 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL7AP62424 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms