Protein–RNA interactions for Protein: P61077

UBE2D3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D3P61077 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms