Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms