Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBX4P57082 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBX4P57082 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBX4P57082 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBX4P57082 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBX4P57082 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBX4P57082 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBX4P57082 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TBX4P57082 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBX4P57082 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBX4P57082 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBX4P57082 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBX4P57082 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBX4P57082 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBX4P57082 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBX4P57082 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBX4P57082 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBX4P57082 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBX4P57082 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBX4P57082 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBX4P57082 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBX4P57082 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TBX4P57082 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBX4P57082 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBX4P57082 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBX4P57082 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TBX4P57082 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TBX4P57082 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TBX4P57082 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBX4P57082 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBX4P57082 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBX4P57082 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBX4P57082 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBX4P57082 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBX4P57082 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBX4P57082 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBX4P57082 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBX4P57082 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBX4P57082 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBX4P57082 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBX4P57082 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBX4P57082 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBX4P57082 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBX4P57082 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBX4P57082 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBX4P57082 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBX4P57082 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBX4P57082 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX4P57082 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX4P57082 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX4P57082 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX4P57082 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX4P57082 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX4P57082 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX4P57082 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX4P57082 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX4P57082 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX4P57082 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX4P57082 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX4P57082 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX4P57082 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX4P57082 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX4P57082 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX4P57082 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX4P57082 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX4P57082 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX4P57082 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX4P57082 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX4P57082 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX4P57082 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX4P57082 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX4P57082 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX4P57082 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX4P57082 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX4P57082 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX4P57082 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX4P57082 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX4P57082 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX4P57082 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX4P57082 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX4P57082 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX4P57082 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX4P57082 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX4P57082 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX4P57082 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX4P57082 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX4P57082 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX4P57082 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX4P57082 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX4P57082 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX4P57082 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX4P57082 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX4P57082 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX4P57082 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX4P57082 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX4P57082 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX4P57082 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX4P57082 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX4P57082 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX4P57082 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms