Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S2P56377 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S2P56377 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S2P56377 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S2P56377 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S2P56377 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S2P56377 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S2P56377 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S2P56377 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AP1S2P56377 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S2P56377 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S2P56377 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S2P56377 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S2P56377 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S2P56377 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S2P56377 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S2P56377 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S2P56377 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S2P56377 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S2P56377 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S2P56377 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S2P56377 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S2P56377 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S2P56377 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S2P56377 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S2P56377 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S2P56377 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S2P56377 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S2P56377 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S2P56377 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S2P56377 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S2P56377 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S2P56377 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S2P56377 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S2P56377 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S2P56377 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S2P56377 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S2P56377 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S2P56377 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S2P56377 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S2P56377 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S2P56377 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S2P56377 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S2P56377 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S2P56377 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S2P56377 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S2P56377 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AP1S2P56377 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S2P56377 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AP1S2P56377 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S2P56377 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S2P56377 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S2P56377 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S2P56377 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S2P56377 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AP1S2P56377 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S2P56377 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S2P56377 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S2P56377 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S2P56377 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S2P56377 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S2P56377 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AP1S2P56377 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S2P56377 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S2P56377 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S2P56377 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S2P56377 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S2P56377 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S2P56377 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S2P56377 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S2P56377 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AP1S2P56377 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S2P56377 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S2P56377 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S2P56377 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S2P56377 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S2P56377 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S2P56377 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S2P56377 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S2P56377 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S2P56377 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S2P56377 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S2P56377 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S2P56377 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S2P56377 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S2P56377 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S2P56377 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S2P56377 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S2P56377 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S2P56377 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S2P56377 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S2P56377 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S2P56377 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S2P56377 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S2P56377 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S2P56377 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S2P56377 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S2P56377 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S2P56377 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S2P56377 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms