Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAG2P55895 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAG2P55895 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAG2P55895 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAG2P55895 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAG2P55895 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAG2P55895 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAG2P55895 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAG2P55895 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAG2P55895 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAG2P55895 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAG2P55895 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAG2P55895 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAG2P55895 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAG2P55895 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAG2P55895 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAG2P55895 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAG2P55895 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAG2P55895 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAG2P55895 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAG2P55895 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAG2P55895 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAG2P55895 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAG2P55895 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAG2P55895 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAG2P55895 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAG2P55895 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAG2P55895 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAG2P55895 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAG2P55895 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAG2P55895 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAG2P55895 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAG2P55895 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAG2P55895 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAG2P55895 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAG2P55895 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAG2P55895 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RAG2P55895 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAG2P55895 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAG2P55895 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAG2P55895 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAG2P55895 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAG2P55895 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAG2P55895 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAG2P55895 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAG2P55895 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAG2P55895 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAG2P55895 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAG2P55895 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAG2P55895 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAG2P55895 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RAG2P55895 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAG2P55895 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAG2P55895 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAG2P55895 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAG2P55895 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAG2P55895 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAG2P55895 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAG2P55895 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAG2P55895 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAG2P55895 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAG2P55895 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAG2P55895 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAG2P55895 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAG2P55895 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAG2P55895 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAG2P55895 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAG2P55895 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAG2P55895 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAG2P55895 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAG2P55895 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAG2P55895 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAG2P55895 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAG2P55895 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAG2P55895 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAG2P55895 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAG2P55895 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RAG2P55895 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAG2P55895 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAG2P55895 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAG2P55895 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAG2P55895 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAG2P55895 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAG2P55895 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAG2P55895 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAG2P55895 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAG2P55895 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAG2P55895 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAG2P55895 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAG2P55895 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAG2P55895 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAG2P55895 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAG2P55895 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAG2P55895 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms