Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AFDNP55196 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
AFDNP55196 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
AFDNP55196 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
AFDNP55196 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
AFDNP55196 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
AFDNP55196 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
AFDNP55196 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
AFDNP55196 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
AFDNP55196 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AFDNP55196 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AFDNP55196 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AFDNP55196 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AFDNP55196 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AFDNP55196 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AFDNP55196 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AFDNP55196 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AFDNP55196 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
AFDNP55196 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
AFDNP55196 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AFDNP55196 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AFDNP55196 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AFDNP55196 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AFDNP55196 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
AFDNP55196 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AFDNP55196 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AFDNP55196 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AFDNP55196 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AFDNP55196 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AFDNP55196 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AFDNP55196 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AFDNP55196 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AFDNP55196 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AFDNP55196 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AFDNP55196 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AFDNP55196 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AFDNP55196 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
AFDNP55196 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AFDNP55196 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AFDNP55196 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
AFDNP55196 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AFDNP55196 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AFDNP55196 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
AFDNP55196 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AFDNP55196 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AFDNP55196 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AFDNP55196 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AFDNP55196 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AFDNP55196 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AFDNP55196 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AFDNP55196 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFDNP55196 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFDNP55196 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFDNP55196 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFDNP55196 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFDNP55196 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFDNP55196 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
AFDNP55196 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
AFDNP55196 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFDNP55196 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFDNP55196 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFDNP55196 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFDNP55196 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFDNP55196 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFDNP55196 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
AFDNP55196 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFDNP55196 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFDNP55196 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFDNP55196 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFDNP55196 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFDNP55196 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFDNP55196 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFDNP55196 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFDNP55196 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFDNP55196 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFDNP55196 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AFDNP55196 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AFDNP55196 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AFDNP55196 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AFDNP55196 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AFDNP55196 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFDNP55196 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
AFDNP55196 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFDNP55196 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFDNP55196 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFDNP55196 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFDNP55196 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFDNP55196 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFDNP55196 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFDNP55196 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFDNP55196 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFDNP55196 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFDNP55196 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
AFDNP55196 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFDNP55196 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFDNP55196 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFDNP55196 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFDNP55196 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFDNP55196 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFDNP55196 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms