Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AQP4P55087 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AQP4P55087 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AQP4P55087 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AQP4P55087 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AQP4P55087 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AQP4P55087 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AQP4P55087 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AQP4P55087 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AQP4P55087 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AQP4P55087 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AQP4P55087 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AQP4P55087 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AQP4P55087 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AQP4P55087 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AQP4P55087 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AQP4P55087 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AQP4P55087 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AQP4P55087 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AQP4P55087 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AQP4P55087 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AQP4P55087 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AQP4P55087 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AQP4P55087 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AQP4P55087 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AQP4P55087 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AQP4P55087 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AQP4P55087 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AQP4P55087 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AQP4P55087 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AQP4P55087 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AQP4P55087 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AQP4P55087 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AQP4P55087 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AQP4P55087 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AQP4P55087 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AQP4P55087 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AQP4P55087 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AQP4P55087 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AQP4P55087 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AQP4P55087 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AQP4P55087 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AQP4P55087 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AQP4P55087 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AQP4P55087 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AQP4P55087 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AQP4P55087 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AQP4P55087 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AQP4P55087 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AQP4P55087 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AQP4P55087 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AQP4P55087 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AQP4P55087 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AQP4P55087 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AQP4P55087 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AQP4P55087 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AQP4P55087 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AQP4P55087 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AQP4P55087 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
AQP4P55087 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AQP4P55087 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AQP4P55087 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AQP4P55087 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AQP4P55087 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AQP4P55087 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AQP4P55087 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AQP4P55087 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AQP4P55087 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AQP4P55087 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AQP4P55087 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AQP4P55087 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AQP4P55087 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AQP4P55087 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AQP4P55087 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AQP4P55087 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AQP4P55087 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AQP4P55087 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
AQP4P55087 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AQP4P55087 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AQP4P55087 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AQP4P55087 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AQP4P55087 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AQP4P55087 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AQP4P55087 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AQP4P55087 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AQP4P55087 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AQP4P55087 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AQP4P55087 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AQP4P55087 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AQP4P55087 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AQP4P55087 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AQP4P55087 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AQP4P55087 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AQP4P55087 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AQP4P55087 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AQP4P55087 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AQP4P55087 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AQP4P55087 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AQP4P55087 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AQP4P55087 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms