Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEMP55040 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEMP55040 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GEMP55040 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GEMP55040 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GEMP55040 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GEMP55040 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GEMP55040 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GEMP55040 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GEMP55040 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GEMP55040 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GEMP55040 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GEMP55040 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEMP55040 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEMP55040 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEMP55040 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEMP55040 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEMP55040 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEMP55040 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEMP55040 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEMP55040 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEMP55040 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEMP55040 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEMP55040 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEMP55040 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEMP55040 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEMP55040 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEMP55040 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GEMP55040 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GEMP55040 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEMP55040 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEMP55040 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEMP55040 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEMP55040 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEMP55040 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEMP55040 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEMP55040 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GEMP55040 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEMP55040 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEMP55040 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GEMP55040 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GEMP55040 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GEMP55040 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GEMP55040 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GEMP55040 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GEMP55040 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GEMP55040 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEMP55040 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEMP55040 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEMP55040 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEMP55040 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEMP55040 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEMP55040 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEMP55040 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEMP55040 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEMP55040 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEMP55040 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEMP55040 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEMP55040 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEMP55040 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEMP55040 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEMP55040 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEMP55040 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEMP55040 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GEMP55040 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEMP55040 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEMP55040 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEMP55040 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEMP55040 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEMP55040 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEMP55040 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEMP55040 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GEMP55040 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEMP55040 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEMP55040 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GEMP55040 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEMP55040 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GEMP55040 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GEMP55040 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GEMP55040 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GEMP55040 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GEMP55040 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GEMP55040 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GEMP55040 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GEMP55040 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GEMP55040 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GEMP55040 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GEMP55040 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GEMP55040 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GEMP55040 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GEMP55040 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GEMP55040 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GEMP55040 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GEMP55040 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GEMP55040 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GEMP55040 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GEMP55040 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GEMP55040 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GEMP55040 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GEMP55040 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms