Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAPAP54920 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAPAP54920 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAPAP54920 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAPAP54920 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAPAP54920 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAPAP54920 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAPAP54920 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAPAP54920 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAPAP54920 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAPAP54920 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAPAP54920 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NAPAP54920 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NAPAP54920 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NAPAP54920 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAPAP54920 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAPAP54920 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAPAP54920 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NAPAP54920 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAPAP54920 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NAPAP54920 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAPAP54920 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAPAP54920 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAPAP54920 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NAPAP54920 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAPAP54920 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAPAP54920 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAPAP54920 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAPAP54920 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAPAP54920 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAPAP54920 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAPAP54920 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAPAP54920 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAPAP54920 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAPAP54920 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAPAP54920 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAPAP54920 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAPAP54920 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAPAP54920 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAPAP54920 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAPAP54920 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAPAP54920 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAPAP54920 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAPAP54920 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAPAP54920 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAPAP54920 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAPAP54920 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NAPAP54920 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAPAP54920 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAPAP54920 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAPAP54920 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAPAP54920 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAPAP54920 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAPAP54920 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAPAP54920 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAPAP54920 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAPAP54920 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAPAP54920 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAPAP54920 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAPAP54920 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAPAP54920 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAPAP54920 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAPAP54920 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAPAP54920 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAPAP54920 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAPAP54920 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAPAP54920 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAPAP54920 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAPAP54920 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAPAP54920 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAPAP54920 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAPAP54920 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAPAP54920 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAPAP54920 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NAPAP54920 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAPAP54920 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAPAP54920 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAPAP54920 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAPAP54920 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAPAP54920 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAPAP54920 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NAPAP54920 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NAPAP54920 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NAPAP54920 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NAPAP54920 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NAPAP54920 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAPAP54920 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAPAP54920 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAPAP54920 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAPAP54920 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAPAP54920 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAPAP54920 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAPAP54920 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAPAP54920 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAPAP54920 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAPAP54920 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAPAP54920 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAPAP54920 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAPAP54920 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAPAP54920 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms