Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB4P54760 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms