Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNB3P54284 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms