Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms