Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCR4P51679 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCR4P51679 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCR4P51679 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCR4P51679 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCR4P51679 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCR4P51679 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCR4P51679 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCR4P51679 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCR4P51679 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCR4P51679 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCR4P51679 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCR4P51679 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCR4P51679 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCR4P51679 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCR4P51679 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCR4P51679 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCR4P51679 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCR4P51679 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCR4P51679 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCR4P51679 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCR4P51679 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCR4P51679 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCR4P51679 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCR4P51679 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCR4P51679 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCR4P51679 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCR4P51679 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCR4P51679 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCR4P51679 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCR4P51679 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCR4P51679 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCR4P51679 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCR4P51679 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCR4P51679 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCR4P51679 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCR4P51679 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCR4P51679 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCR4P51679 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCR4P51679 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCR4P51679 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCR4P51679 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCR4P51679 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCR4P51679 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCR4P51679 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCR4P51679 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCR4P51679 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCR4P51679 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCR4P51679 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCR4P51679 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCR4P51679 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCR4P51679 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCR4P51679 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCR4P51679 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCR4P51679 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCR4P51679 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCR4P51679 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCR4P51679 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCR4P51679 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCR4P51679 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCR4P51679 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCR4P51679 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCR4P51679 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCR4P51679 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCR4P51679 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCR4P51679 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCR4P51679 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCR4P51679 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCR4P51679 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCR4P51679 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCR4P51679 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCR4P51679 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCR4P51679 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCR4P51679 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCR4P51679 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCR4P51679 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCR4P51679 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCR4P51679 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCR4P51679 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCR4P51679 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCR4P51679 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCR4P51679 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCR4P51679 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCR4P51679 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCR4P51679 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCR4P51679 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCR4P51679 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCR4P51679 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCR4P51679 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCR4P51679 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCR4P51679 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCR4P51679 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCR4P51679 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCR4P51679 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCR4P51679 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCR4P51679 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCR4P51679 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCR4P51679 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCR4P51679 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCR4P51679 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms