Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB28P51157 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB28P51157 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB28P51157 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB28P51157 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB28P51157 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB28P51157 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB28P51157 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB28P51157 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB28P51157 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB28P51157 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB28P51157 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB28P51157 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB28P51157 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB28P51157 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB28P51157 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB28P51157 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB28P51157 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB28P51157 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB28P51157 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB28P51157 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB28P51157 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB28P51157 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB28P51157 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB28P51157 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB28P51157 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB28P51157 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB28P51157 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB28P51157 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB28P51157 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB28P51157 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB28P51157 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB28P51157 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB28P51157 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB28P51157 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB28P51157 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB28P51157 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB28P51157 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB28P51157 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB28P51157 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB28P51157 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB28P51157 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB28P51157 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB28P51157 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB28P51157 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB28P51157 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB28P51157 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB28P51157 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB28P51157 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB28P51157 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB28P51157 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB28P51157 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB28P51157 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB28P51157 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB28P51157 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB28P51157 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB28P51157 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB28P51157 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB28P51157 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB28P51157 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB28P51157 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB28P51157 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB28P51157 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB28P51157 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB28P51157 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB28P51157 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB28P51157 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB28P51157 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB28P51157 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB28P51157 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB28P51157 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB28P51157 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB28P51157 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB28P51157 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB28P51157 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB28P51157 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB28P51157 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB28P51157 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB28P51157 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB28P51157 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB28P51157 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB28P51157 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB28P51157 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB28P51157 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB28P51157 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB28P51157 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB28P51157 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB28P51157 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB28P51157 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB28P51157 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB28P51157 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB28P51157 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB28P51157 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB28P51157 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB28P51157 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB28P51157 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB28P51157 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB28P51157 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB28P51157 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB28P51157 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms