Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IDH3AP50213 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IDH3AP50213 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IDH3AP50213 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IDH3AP50213 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IDH3AP50213 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
IDH3AP50213 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IDH3AP50213 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IDH3AP50213 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IDH3AP50213 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IDH3AP50213 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IDH3AP50213 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IDH3AP50213 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IDH3AP50213 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IDH3AP50213 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IDH3AP50213 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IDH3AP50213 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IDH3AP50213 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IDH3AP50213 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IDH3AP50213 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IDH3AP50213 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IDH3AP50213 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IDH3AP50213 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IDH3AP50213 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IDH3AP50213 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IDH3AP50213 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IDH3AP50213 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IDH3AP50213 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IDH3AP50213 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IDH3AP50213 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IDH3AP50213 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IDH3AP50213 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IDH3AP50213 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IDH3AP50213 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IDH3AP50213 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IDH3AP50213 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IDH3AP50213 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IDH3AP50213 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IDH3AP50213 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IDH3AP50213 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IDH3AP50213 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IDH3AP50213 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IDH3AP50213 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IDH3AP50213 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IDH3AP50213 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IDH3AP50213 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IDH3AP50213 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms