Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLK2P49760 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLK2P49760 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLK2P49760 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLK2P49760 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLK2P49760 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLK2P49760 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLK2P49760 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLK2P49760 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLK2P49760 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK2P49760 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK2P49760 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK2P49760 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK2P49760 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK2P49760 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK2P49760 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK2P49760 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK2P49760 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK2P49760 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLK2P49760 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLK2P49760 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLK2P49760 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLK2P49760 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLK2P49760 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLK2P49760 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLK2P49760 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLK2P49760 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLK2P49760 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK2P49760 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK2P49760 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK2P49760 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK2P49760 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK2P49760 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK2P49760 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK2P49760 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK2P49760 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK2P49760 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK2P49760 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK2P49760 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK2P49760 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK2P49760 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK2P49760 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK2P49760 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLK2P49760 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLK2P49760 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLK2P49760 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLK2P49760 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLK2P49760 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLK2P49760 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLK2P49760 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLK2P49760 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLK2P49760 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLK2P49760 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLK2P49760 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLK2P49760 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLK2P49760 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLK2P49760 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLK2P49760 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLK2P49760 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLK2P49760 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLK2P49760 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK2P49760 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK2P49760 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK2P49760 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK2P49760 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK2P49760 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK2P49760 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK2P49760 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK2P49760 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK2P49760 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK2P49760 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK2P49760 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK2P49760 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK2P49760 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK2P49760 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLK2P49760 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLK2P49760 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLK2P49760 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLK2P49760 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLK2P49760 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLK2P49760 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLK2P49760 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLK2P49760 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLK2P49760 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK2P49760 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK2P49760 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK2P49760 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK2P49760 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK2P49760 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK2P49760 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK2P49760 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK2P49760 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK2P49760 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK2P49760 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK2P49760 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK2P49760 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK2P49760 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK2P49760 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK2P49760 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLK2P49760 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms