Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HARS2P49590 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HARS2P49590 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HARS2P49590 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HARS2P49590 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HARS2P49590 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HARS2P49590 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HARS2P49590 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HARS2P49590 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HARS2P49590 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HARS2P49590 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HARS2P49590 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HARS2P49590 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HARS2P49590 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HARS2P49590 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HARS2P49590 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HARS2P49590 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HARS2P49590 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HARS2P49590 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HARS2P49590 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HARS2P49590 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HARS2P49590 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HARS2P49590 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HARS2P49590 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HARS2P49590 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HARS2P49590 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HARS2P49590 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HARS2P49590 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HARS2P49590 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HARS2P49590 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HARS2P49590 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HARS2P49590 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HARS2P49590 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HARS2P49590 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HARS2P49590 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HARS2P49590 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HARS2P49590 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HARS2P49590 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HARS2P49590 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HARS2P49590 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HARS2P49590 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HARS2P49590 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HARS2P49590 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HARS2P49590 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HARS2P49590 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HARS2P49590 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HARS2P49590 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HARS2P49590 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HARS2P49590 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HARS2P49590 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HARS2P49590 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HARS2P49590 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HARS2P49590 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HARS2P49590 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HARS2P49590 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HARS2P49590 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HARS2P49590 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HARS2P49590 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HARS2P49590 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HARS2P49590 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HARS2P49590 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HARS2P49590 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HARS2P49590 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HARS2P49590 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HARS2P49590 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HARS2P49590 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HARS2P49590 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HARS2P49590 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HARS2P49590 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HARS2P49590 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HARS2P49590 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HARS2P49590 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HARS2P49590 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HARS2P49590 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HARS2P49590 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HARS2P49590 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HARS2P49590 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HARS2P49590 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HARS2P49590 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HARS2P49590 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HARS2P49590 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HARS2P49590 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HARS2P49590 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HARS2P49590 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HARS2P49590 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HARS2P49590 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HARS2P49590 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HARS2P49590 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HARS2P49590 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HARS2P49590 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HARS2P49590 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HARS2P49590 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HARS2P49590 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HARS2P49590 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HARS2P49590 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HARS2P49590 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HARS2P49590 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HARS2P49590 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HARS2P49590 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HARS2P49590 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms