Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARCN1P48444 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms